Shaw's Blog
多个图形组合展示 多个图形组合展示
cowplot多个panel的排列 多个 panel 的排列控制cowplot library(cowplot) plot_grid(p1, p2) ggdraw() + draw_plot(p1, xstart, ystar
2022-10-07 梁绍波
R ggplot2
颜色搭配设计方案 颜色搭配设计方案
能够为统计图表设置合适的颜色搭配，能够提升文章品质。 ggsciRColorBrewercolorspaceggplot2之数据可视化中的配色
2022-10-06 R数据可视化手册
R ggplot2
基因结构图的绘制 基因结构图的绘制
绘制基因结构图的需求比较普遍，也常常会和其他数据如 track plot 合并在一起，所以在这里特别开一篇，简单介绍一些工具。 ggbio从名字上就能看出，这是具有 ggplot2 属性的工具包，熟悉 ggplot2 的同学，用这个包可以说
2022-10-06 R
gene
linux其他常用命令 linux其他常用命令
大小写转换tr$ echo file | tr a-z A-Z FILE $ echo FILE | tr A-Z a-z file $ tr [:lower:] [:upper:] $ tr [:upper:] [:lower:]
2022-09-29 linux
cmd
linux命令——expr linux命令——expr
手工命令计数器
2022-09-29 linux
cmd expr
linux命令——grep linux命令——grep
grep用于查找文件里符合条件的字符串。 常用选项–after-context=<显示行数>-A <显示行数> ， 除了显示符合范本样式的那一列之外，并显示之后的指定行 –before-context=<显示行
2022-09-29 linux
cmd grep
文献写作素材积累 文献写作素材积累
积累文献中各种常用词汇，词组和句型句式
2022-09-29 paper
vacabulary
linux命令——parallel linux命令——parallel
用好 parallel 简单实现多进程，从此起飞
2022-09-25 linux
cmd parallel
peak calling 与 merge peak calling 与 merge
TF、histone 等 ChIP-seq, RBP 的 CLIP 中的 peak calling 是分析过程中重要的一环 peak callingmacs2SICER(2)使用SICER进行peak calling现如今已有 versio
2022-09-15 梁绍波
peak
R 常用的命令（非数据操作类） R 常用的命令（非数据操作类）
options 全局设置# 关闭所有的图形窗口，常用于R包安装，选择镜像源时 options(main.graphics=FALSE) # increasing the download timeout options(timeout =
2022-09-14 R
normalize 和差异分析 normalize 和差异分析
差异表达差异，剪接变化差异，和富集差异等等，如何从生物信息学的角度理解差异？ 剪接差异 应该最为容易理解：通过计算PSI(percent spliced in)值，进而得到样本间变化的 ΔPSI(PSI1-PSI2)。 表达差异（这里表达简
2022-09-13 梁绍波
scRNA-seq scRNA-seq
—————- 2023.03.06 ———————-俺来填坑了！！！ scRNA-seq analysis 大体分两个模块： 测序数据前期处理转为矩阵数据挖掘 前期处理，包括 barcode 的拆解，比对。利用比对结果，进行定量，去除 d
2022-09-09 bioinformatics
scRNA-seq
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