归档
06
19
ImageJ用于条带灰度值定量的用法 ImageJ用于条带灰度值定量的用法
RT-PCR的条带定量,是基因表达量的比较和剪接水平的定量的非常好的办法。下面介绍一下主要操作步骤: 导入胶图 原始胶图一般是黑底的,所以要进行反向 将图像进制转变为8bit;iff默认就是8bit的 然后进行正式的定量操作:
2025-06-19 梁绍波
04
07
剪接事件检测工具之SUPPA 剪接事件检测工具之SUPPA
使用rmats检测AS事件,用了越来越多后发现,当剪接事件很少时,会报告很多“难以验证”的AS事件(sashimiplot里面有对应的junction,但是看IGV很难看出区别)。 为了提高AS检测的准确性,现转向其他软件。 今天介绍一下S
2025-04-07 梁绍波
03
09
氨基酸序列无序性预测 氨基酸序列无序性预测
除了用alphaFold去预测蛋白质结构,也可以disopred预测氨基酸的无序性,用来看一些特殊的结构。 disopred中有两个版本的 run_disopred.pl,一个是在文件夹的第一层,另外一个是在**BLAST+/**子文件夹中
2025-03-09 梁绍波
02
20
文献速览 2025.02.20期 文献速览 2025.02.20期
Stork推送:2025.02.20lncRNA编码蛋白并调节主动脉夹层分离nature communication. 2025.2.18 GMRSP encoded by lncRNA H19 regulates metabolic
2025-02-20
12
29
IgG welds aging and obesity (北京大学 强力) IgG welds aging and obesity (北京大学 强力)
2024/12/29 北京大学强力教授在“湖北省生物学基础学科研究中心交流会上”做了名为”IgG welds aging and obesity”的报告 让我了解到: 衰老与肥胖有非常多的共同的并发症状 IgG在脂肪组织中大量堆积,个体的
2024-12-29 梁绍波
11
18
07
RIP-seq实验方法 RIP-seq实验方法
参考1:METTL16 promotes liver cancer stem cell self-renewal via controlling ribosome biogenesis and mRNA translation 参考2:ab
2024-11-07 梁绍波
06
CLIP实验方法 CLIP实验方法
CLIP-seq早已是被广泛使用的protein-RNA结合互作位点研究的方法,但我们自己做的非常少,除了实验室老一辈人有的做过,现在的同学都没人做过,所以只好自己上,钻研一下CLIP的实验方法。 有些抑制剂和磷酸酶,如果没有,可尝试不加。
2024-11-06 梁绍波
04
10
22
20
AP-MS鉴定互作蛋白 AP-MS鉴定互作蛋白
Affinity-Purification Mass Spectrometry (AP-MS)亲和纯化质谱是研究蛋白质分子间相互作用的重要手段。 参考1: Genome-scale exon perturbation screens unc
2024-10-20
1 / 9