参考1：METTL16 promotes liver cancer stem cell self-renewal via controlling ribosome biogenesis and mRNA translation 参考2：ab

CLIP-seq早已是被广泛使用的protein-RNA结合互作位点研究的方法，但我们自己做的非常少，除了实验室老一辈人有的做过，现在的同学都没人做过，所以只好自己上，钻研一下CLIP的实验方法。 有些抑制剂和磷酸酶，如果没有，可尝试不加。

参考1：Methods to study RNA–protein interactions

纯化标签N端还是C端纯化标签+检测标签linker加还是不加参考1:蛋白表达纯化如何选择标签

Affinity-Purification Mass Spectrometry (AP-MS)亲和纯化质谱是研究蛋白质分子间相互作用的重要手段。 参考1: Genome-scale exon perturbation screens unc

在研究一个基因时，常常会需要了解这个基因的（核苷酸或氨基酸）序列在物种间的保守性。下面提供一种查询基因同源情况、序列比对及可视化的方法。以基因 SF3B1 为例： 基因在物种间的保守性如果是well-known的基因，保守性大概了解，可以自

Co-IP Procedure (from XGD)(1) Preparing magnetic beads (for 6-well plate) Aliquot 7 µl of Protein A beads (mouse an

Table 1 CLIP and non-CLIP methodologies for profiling protein–RNA interactions Identify RNAs bound to proteinUltraviol

UCSC genome browser session 能方便的将测序数据结果的track文件展现出来，有一些文章也要求有全基因组测序数据的投稿，要附带session链接，如 Nucleic Acids Research (NAR) 本篇b