Shaw's Blog
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R数据可视化手册-上
博主最开始正式学习 R 语言的时候，是出于数据可视化的目的，以 Oreilly 的《R数据可视化手册》 为 handbook，将此书的 90% 内容在 jupyter 中都复现了一遍。jupyter 原始文件可到我的 Github 相应仓库中获取。由于内容较多，分为了上下两部分。
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R数据可视化手册-下
博主最开始正式学习 R 语言的时候，是出于数据可视化的目的，以 Oreilly 的《R数据可视化手册》 为 handbook，将此书的 90% 内容在 jupyter 中都复现了一遍。jupyter 原始文件可到我的 Github 相应仓库中获取。由于内容较多，分为了上下两部分。
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文献速览 2025.02.20期 文献速览 2025.02.20期
Stork推送：2025.02.20lncRNA编码蛋白并调节主动脉夹层分离nature communication. 2025.2.18 GMRSP encoded by lncRNA H19 regulates metabolic
2025-02-20 paper
IgG welds aging and obesity (北京大学 强力) IgG welds aging and obesity (北京大学 强力)
2024/12/29 北京大学强力教授在“湖北省生物学基础学科研究中心交流会上”做了名为”IgG welds aging and obesity”的报告 让我了解到： 衰老与肥胖有非常多的共同的并发症状 IgG在脂肪组织中大量堆积，个体的
2024-12-29 梁绍波
report
PaperRead-TDP43-UNC13A-for-ALS PaperRead-TDP43-UNC13A-for-ALS
2024-11-18 梁绍波
分布检验之-KS检验 分布检验之-KS检验
2024-11-15 statistics
KS test
RIP-seq实验方法 RIP-seq实验方法
参考1：METTL16 promotes liver cancer stem cell self-renewal via controlling ribosome biogenesis and mRNA translation 参考2：ab
2024-11-07 梁绍波
CLIP实验方法 CLIP实验方法
CLIP-seq早已是被广泛使用的protein-RNA结合互作位点研究的方法，但我们自己做的非常少，除了实验室老一辈人有的做过，现在的同学都没人做过，所以只好自己上，钻研一下CLIP的实验方法。 有些抑制剂和磷酸酶，如果没有，可尝试不加。
2024-11-06 梁绍波
RNA-protein互作研究方法 RNA-protein互作研究方法
参考1：Methods to study RNA–protein interactions
2024-11-04 wetlab
蛋白质标签抗体的选择 蛋白质标签抗体的选择
纯化标签N端还是C端纯化标签+检测标签linker加还是不加参考1:蛋白表达纯化如何选择标签
2024-10-22 wetlab
AP-MS鉴定互作蛋白 AP-MS鉴定互作蛋白
Affinity-Purification Mass Spectrometry (AP-MS)亲和纯化质谱是研究蛋白质分子间相互作用的重要手段。 参考1: Genome-scale exon perturbation screens unc
2024-10-20 wetlab
物种进化与多序列比对 物种进化与多序列比对
在研究一个基因时，常常会需要了解这个基因的（核苷酸或氨基酸）序列在物种间的保守性。下面提供一种查询基因同源情况、序列比对及可视化的方法。以基因 SF3B1 为例： 基因在物种间的保守性如果是well-known的基因，保守性大概了解，可以自
2024-10-14 bioinformatics
CoIP protocol CoIP protocol
Co-IP Procedure (from XGD)(1) Preparing magnetic beads (for 6-well plate) Aliquot 7 µl of Protein A beads (mouse an
2024-10-09 wetlab
wetlab-spCas9KO wetlab-spCas9KO
2024-08-03 wetlab
Cas9 KO
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