2024-11-18
分布检验之-KS检验
2024-11-15
RIP-seq实验方法
参考1：METTL16 promotes liver cancer stem cell self-renewal via controlling ribosome biogenesis and mRNA translation
参考2：ab
2024-11-07
CLIP实验方法
CLIP-seq早已是被广泛使用的protein-RNA结合互作位点研究的方法，但我们自己做的非常少，除了实验室老一辈人有的做过，现在的同学都没人做过，所以只好自己上，钻研一下CLIP的实验方法。
有些抑制剂和磷酸酶，如果没有，可尝试不加。
2024-11-06
RNA-protein互作研究方法
参考1：Methods to study RNA–protein interactions
2024-11-04
蛋白质标签抗体的选择
纯化标签N端还是C端纯化标签+检测标签linker加还是不加参考1:蛋白表达纯化如何选择标签
2024-10-22
AP-MS鉴定互作蛋白
Affinity-Purification Mass Spectrometry (AP-MS)亲和纯化质谱是研究蛋白质分子间相互作用的重要手段。
参考1: Genome-scale exon perturbation screens unc
2024-10-20
物种进化与多序列比对
在研究一个基因时，常常会需要了解这个基因的（核苷酸或氨基酸）序列在物种间的保守性。下面提供一种查询基因同源情况、序列比对及可视化的方法。以基因 SF3B1 为例：
基因在物种间的保守性如果是well-known的基因，保守性大概了解，可以自
2024-10-14
CoIP protocol
Co-IP Procedure (from XGD)(1) Preparing magnetic beads (for 6-well plate)
Aliquot 7 µl of Protein A beads (mouse an
2024-10-09
wetlab-spCas9KO
2024-08-03
PaperRead-CLIP-moethod
Table 1 CLIP and non-CLIP methodologies for profiling protein–RNA interactions
Identify RNAs bound to proteinUltraviol
2024-07-11
UCSC browser session
UCSC genome browser session 能方便的将测序数据结果的track文件展现出来，有一些文章也要求有全基因组测序数据的投稿，要附带session链接，如 Nucleic Acids Research (NAR)
本篇b
2024-07-02