Shaw's Blog
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R数据可视化手册-上
博主最开始正式学习 R 语言的时候，是出于数据可视化的目的，以 Oreilly 的《R数据可视化手册》 为 handbook，将此书的 90% 内容在 jupyter 中都复现了一遍。jupyter 原始文件可到我的 Github 相应仓库中获取。由于内容较多，分为了上下两部分。
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R数据可视化手册-下
博主最开始正式学习 R 语言的时候，是出于数据可视化的目的，以 Oreilly 的《R数据可视化手册》 为 handbook，将此书的 90% 内容在 jupyter 中都复现了一遍。jupyter 原始文件可到我的 Github 相应仓库中获取。由于内容较多，分为了上下两部分。
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R图形组合工具包——patchwork R图形组合工具包——patchwork
patchwork 是 ggplot2 生态系统中最强大的图形组合工具，它能智能地对齐图表轴线。 合并总结只有纵向/横向排布# 横向排布 p1 + p2 + plot_layout( widths = c(3,1),
2025-11-04 R数据可视化手册
R
job-search-info-summary job-search-info-summary
工作面试准备着装 准备一套正装 应试材料 简历 面向企业 面向公务员、事业单位 笔试 申论（视频学习，每日一练，总结概括题、大作文） 面试 面试策略，宝宝总结的题目 其他材料（已备齐） 工作选择从能力适配、待遇
2025-09-17 梁绍波
ImageJ用于条带灰度值定量的用法 ImageJ用于条带灰度值定量的用法
RT-PCR的条带定量，是基因表达量的比较和剪接水平的定量的非常好的办法。下面介绍一下主要操作步骤： 导入胶图 原始胶图一般是黑底的，所以要进行反向 将图像进制转变为8bit；tiff默认就是8bit的 然后进行正式的定量操作：
2025-06-19 梁绍波
imagej
剪接事件检测工具之SUPPA 剪接事件检测工具之SUPPA
使用rmats检测AS事件，用了越来越多后发现，当剪接事件很少时，会报告很多“难以验证”的AS事件（sashimiplot里面有对应的junction，但是看IGV很难看出区别）。 为了提高AS检测的准确性，现转向其他软件。 今天介绍一下S
2025-04-07 梁绍波
氨基酸序列无序性预测 氨基酸序列无序性预测
除了用alphaFold去预测蛋白质结构，也可以disopred预测氨基酸的无序性，用来看一些特殊的结构。 disopred中有两个版本的 run_disopred.pl，一个是在文件夹的第一层，另外一个是在**BLAST+/**子文件夹中
2025-03-09 梁绍波
文献速览 2025.02.20期 文献速览 2025.02.20期
Stork推送：2025.02.20lncRNA编码蛋白并调节主动脉夹层分离nature communication. 2025.2.18 GMRSP encoded by lncRNA H19 regulates metabolic
2025-02-20 paper
IgG welds aging and obesity (北京大学 强力) IgG welds aging and obesity (北京大学 强力)
2024/12/29 北京大学强力教授在“湖北省生物学基础学科研究中心交流会上”做了名为”IgG welds aging and obesity”的报告 让我了解到： 衰老与肥胖有非常多的共同的并发症状 IgG在脂肪组织中大量堆积，个体的
2024-12-29 梁绍波
report
PaperRead-TDP43-UNC13A-for-ALS PaperRead-TDP43-UNC13A-for-ALS
2024-11-18 梁绍波
分布检验之-KS检验 分布检验之-KS检验
2024-11-15 statistics
KS test
RIP-seq实验方法 RIP-seq实验方法
参考1：METTL16 promotes liver cancer stem cell self-renewal via controlling ribosome biogenesis and mRNA translation 参考2：ab
2024-11-07 梁绍波
CLIP实验方法 CLIP实验方法
CLIP-seq早已是被广泛使用的protein-RNA结合互作位点研究的方法，但我们自己做的非常少，除了实验室老一辈人有的做过，现在的同学都没人做过，所以只好自己上，钻研一下CLIP的实验方法。 有些抑制剂和磷酸酶，如果没有，可尝试不加。
2024-11-06 梁绍波
RNA-protein互作研究方法 RNA-protein互作研究方法
参考1：Methods to study RNA–protein interactions
2024-11-04 wetlab
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