纯化标签N端还是C端纯化标签+检测标签linker加还是不加参考1:蛋白表达纯化如何选择标签
2024-10-22
AP-MS鉴定互作蛋白
Affinity-Purification Mass Spectrometry (AP-MS)亲和纯化质谱是研究蛋白质分子间相互作用的重要手段。
参考1: Genome-scale exon perturbation screens unc
2024-10-20
物种进化与多序列比对
在研究一个基因时，常常会需要了解这个基因的（核苷酸或氨基酸）序列在物种间的保守性。下面提供一种查询基因同源情况、序列比对及可视化的方法。以基因 SF3B1 为例：
基因在物种间的保守性如果是well-known的基因，保守性大概了解，可以自
2024-10-14
CoIP protocol
Co-IP Procedure (from XGD)(1) Preparing magnetic beads (for 6-well plate)
Aliquot 7 µl of Protein A beads (mouse an
2024-10-09
wetlab-spCas9KO
2024-08-03
PaperRead-CLIP-moethod
Table 1 CLIP and non-CLIP methodologies for profiling protein–RNA interactions
Identify RNAs bound to proteinUltraviol
2024-07-11
UCSC browser session
UCSC genome browser session 能方便的将测序数据结果的track文件展现出来，有一些文章也要求有全基因组测序数据的投稿，要附带session链接，如 Nucleic Acids Research (NAR)
本篇b
2024-07-02
git/github basic usage guide
一些 git 常用命令，用作备忘录、使用手册，方便快速查阅
2024-06-26
git 的进阶用法
.gitignore让 git 忽略或不追踪特定的文件.gitignore 是一个纯文本文件，将不想被追踪的文件或文件夹名写入其中
在根目录中创建 .gitignore 文件写入的内容格式，可以是个文件名，
test
也可以是文件夹，
2024-06-26
同源基因分析（根据氨基酸序列）
目的：分析同源基因的进化情况做法：
获取同源基因编码的氨基酸序列
序列比对
构建进化树
绘制进化树
下面逐步进行拆解：
1. 获取氨基酸序列可以利用某个物种已知的蛋白质序列，在NCBI blastp进行searc
2024-06-18
scRNA-seq 学习笔记
t-SNE参考:t-SNE: non-linear Dimensionality Reduction
2024-04-06
软件安装遇到的事儿
conda 安装速度慢更换国内源
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add
2024-03-13