ImageJ用于条带灰度值定量的用法


RT-PCR的条带定量,是基因表达量的比较和剪接水平的定量的非常好的办法。下面介绍一下主要操作步骤:

  1. 导入胶图
  2. 原始胶图一般是黑底的,所以要进行反向
  3. 将图像进制转变为8bit;iff默认就是8bit的

然后进行正式的定量操作:

  1. 用矩形框选目的条带,然后analyze->gels->select first lane,或者使用快捷键Ctrl+1
  1. 然后拖动矩形框(不能重新绘制,因为要保证所有矩形框大小相同),到下一个条带的位置,analyze->gels->select next lane,或者使用快捷键Ctrl+2
  1. 重复step 5,直至所有目的条带被框选
  2. analyze->gels->plot lanes,或者使用快捷键Ctrl+3,绘制覆盖图
  1. 使用魔法棒工具,对准峰图的位置,点击,即可获得该区域的覆盖度

在使用时,经常会遇到,峰图与X轴不能形成一个密闭的区域,导致选取区域错误。在出现这种情况时,可以使用直线工具,手动添加线条,形成一个密闭区域,但是要注意,线条添加尽可能合理,不要导致结果大量偏移初始值。


文章作者: 梁绍波
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