TF、histone 等 ChIP-seq, RBP 的 CLIP 中的 peak calling 是分析过程中重要的一环
peak calling
macs2
SICER(2)
使用SICER进行peak calling
现如今已有 version2:Redesigned and improved ChIP-seq broad peak calling tool SICER
几种 peak callers 比较
Features that define the best ChIP-seq peak calling algorithms
