CLIP-seq 中鉴定出的 circRNA-binding events
杂志: Brief Bioinfo(Briefings in Bioinformatics)
CLIP-seq 鉴定出 circRNA-binding 也不是什么新奇的技术,在 CLIP 数据中,找出 back-splicing 的 exon-exon junction reads,就应该属于是 circRNA-binding events,只不过在计算上相比于 linear RNA transcript 更加复杂一些。这篇文章主要是计算方法的开发。关于详细的 circRNA 和 linear RNA 的 CLIP-seq 数据处理流程的区别,可在了解 routine linear RNA computational pipeline 后,进一步掌握。